张大妈

DNA引导CRISPR来了:基因编辑迈入常温稳定新时代

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05-18 10:20

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【#看不见的细菌大战#?】捕猎细菌时,噬菌体会将自身遗传信息注入细菌,“劫持”并接管其内部系统,在几分钟内大量复制自身,最终裂解细胞壁并释放新生子代。而细菌会通过CRISPR/Cas系统建立“免疫记忆”,精准切割再次入侵的病毒DNA。#中国科普博览# CCTV纪录的微博视频
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【#首次揭示DNA解结全过程#!】DNA在细胞复制、转录过程中常会产生缠绕和打结,II型DNA拓扑异构酶就像“分子魔术师”,能切断并解开这些结,维持染色体稳定。过去科学家已经了解这种酶如何结合并切割DNA的“门片段”(G-DNA),但对另一条DNA片段(T-DNA)如何被捕获和转运这一关键步骤,却一直缺乏直观的结构证据。近日,中国科学院生物物理研究所研究团队利用冷冻电镜技术,首次解析出T-DNA被稳定捕获在II型拓扑异构酶中央腔室的三维精细结构(分辨率约3埃)。该结构显示,酶在结合T-DNA时的构象与其空载状态或仅结合G-DNA时明显不同。研究观察到,该状态下G-DNA呈松散结合,这提示我们,这一构象可能发生在G-DNA被切断并重新连接后。在此基础上,团队提出了一种新的机制:酶可能沿着已连接但未完全释放的G-DNA滑动,实现高效连续催化。进一步的突变实验发现,酶上一个名为Arg375的氨基酸残基对T-DNA转运至关重要,改变其电荷特性会显著抑制酶的“解结”能力。这项研究填补了II型拓扑异构酶催化循环中关键环节的结构空白,不仅深化了对这类酶工作机制的理解,也为未来设计针对T-DNA转运过程的抗感染和抗肿瘤药物提供了新的潜在靶点。相关成果已发表在《科学进展》期刊上。#中国科普博览#
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1. 【#看不见的细菌大战#?】捕猎细菌时,噬菌体会将自身遗传信息注入细菌,“劫持”并接管其内部系统,在几分钟内大量复制自身,最终裂解细胞壁并释放新生子代。而细菌会通过CRISPR/Cas系统建立“免疫记忆”,精准切割再次入侵的病毒DNA。#中国科普博览# CCTV纪录的微博视频

2. 【#首次揭示DNA解结全过程#!】DNA在细胞复制、转录过程中常会产生缠绕和打结,II型DNA拓扑异构酶就像“分子魔术师”,能切断并解开这些结,维持染色体稳定。过去科学家已经了解这种酶如何结合并切割DNA的“门片段”(G-DNA),但对另一条DNA片段(T-DNA)如何被捕获和转运这一关键步骤,却一直缺乏直观的结构证据。近日,中国科学院生物物理研究所研究团队利用冷冻电镜技术,首次解析出T-DNA被稳定捕获在II型拓扑异构酶中央腔室的三维精细结构(分辨率约3埃)。该结构显示,酶在结合T-DNA时的构象与其空载状态或仅结合G-DNA时明显不同。研究观察到,该状态下G-DNA呈松散结合,这提示我们,这一构象可能发生在G-DNA被切断并重新连接后。在此基础上,团队提出了一种新的机制:酶可能沿着已连接但未完全释放的G-DNA滑动,实现高效连续催化。进一步的突变实验发现,酶上一个名为Arg375的氨基酸残基对T-DNA转运至关重要,改变其电荷特性会显著抑制酶的“解结”能力。这项研究填补了II型拓扑异构酶催化循环中关键环节的结构空白,不仅深化了对这类酶工作机制的理解,也为未来设计针对T-DNA转运过程的抗感染和抗肿瘤药物提供了新的潜在靶点。相关成果已发表在《科学进展》期刊上。#中国科普博览#

3. 【#大片段DNA染色体成功整合#!】近期,中国科学院分子植物科学卓越创新中心开发了创新的、基于可重复利用靶点的大片段DNA染色体整合策略,构建了首株能够脱离质粒、稳定合成红霉素A的大肠杆菌菌株,并提升了产量。红霉素是临床重要的广谱大环内酯类抗生素。传统研究多采用多质粒系统进行表达,但质粒的不稳定性、抗生素的使用及细胞代谢负担过重,限制了生产效率提升。为了解决这一难题,该研究开发了基于CRISPR/Cas9的可重复利用靶点工具包。这一工具包针对不同长度的片段采取了差异化策略。对于大于10 kb的片段,采用两步整合法,利用限制性内切酶从质粒直接切割大片段作为供体DNA,避免了长片段PCR引入突变的风险;对于小于5 kb的片段,采用迭代整合法,在同一靶点进行连续组装。通过该技术,研究将23个红霉素合成相关基因,精确集成到大肠杆菌BAP1的染色体上,获得了工程菌株sZG9,这是全球首个实现无质粒红霉素A生物合成的大肠杆菌菌株。在实现染色体稳定集成后,研究进一步针对红霉素合成中的前体供应瓶颈,进行了深度的代谢工程优化。经过多轮迭代优化,菌株sZG135的红霉素A产量达到9.80 mg/L,较初始菌株实现了8.25倍的增长,刷新了目前大肠杆菌合成红霉素A的最高产量纪录。目前,相关研究成果已发表于《生物资源技术》。#中国科普博览#

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