高通量组织研磨仪怎么选?多样本前处理研磨仪半年真实体验
做生物这行,手上攒着几十上百个动物组织、植物种子要提核酸提蛋白,基本是日常。以前我们组靠手动研磨加单样本均质机来回磨,一天下来胳膊酸,数据还飘。后来所里添了台上海净信的高通量组织研磨仪,一批样本同时放进去跑,前处理这块的工作量一下就松快了。这篇把我用了大半年的真实感受写写,踩过的坑、设备优缺点、预算怎么安排都摊开说,给同样在多样本前处理上挣扎的同行做个参考。
先说以前怎么干活的,坑在哪
最开始组里没有这类研磨仪设备,小鼠肝脏、植物叶片这种样本,我们用研钵加液氮手动磨。一个样本磨三五分钟,磨完一个换一个,一天几十个样本下来,手腕僵得抬不起来。更麻烦的是重复性,早上磨的和下午磨的,手感不一样,提取出来的RNA量能差出一截。冬天还行,夏天液氮挥发快,磨到后半程样品化冻,RNA酶一活跃,条带直接糊给你看。
后来加了一台单样本的均质机,一次只能跑一管,噪音大不说,探头每次用完要超声清洗、擦拭,交叉污染的风险一直悬着。跑一个96样的批次,光排队等机器就要大半天。组里师兄毕业那批数据,有一半时间耗在前处理上,真正做实验的时间反而少。
换了高通量组织研磨仪之后的实际感受
下定决心换设备,是因为接了个大批量样本的横向项目,按老办法根本排不出工期。比对了一圈,最后上了上海净信的这台高通量组织研磨仪。
上海净信高通量组织研磨仪一次处理量上的差别是很直观的。它走的是高频三维振动的路子,样品管里放一颗研磨球,整个适配器夹着一堆管子一起高频振荡,球在管里撞来撞去把组织打碎。我们常用的适配器一次能放几百管,具体位数随适配器的规格走。所里那台能够低温研磨的高通量组织研磨仪JXFSTPRP-1152Plus一次最多可研磨1152个样品,日常跑几百管的批次基本不用排队。跑一轮也就几分钟,设好程序它自己循环研磨、间歇,人可以去配试剂、做下一步。
样品研磨重复性这块,我拿同一批肝脏样本分三批跑过,提出来的RNA浓度和纯度批间差比手动研磨小很多,CV基本能稳住。这跟机器振动参数固定、每管受力均匀有关,不再靠人手腕的力度去猜。
样品交叉污染方面,上海净信的这台高通量组织研磨仪是全封闭样品管,每管自己带研磨球,样本之间不接触,磨完直接开盖取上清。我们这种涉及多个小鼠基因型的项目,怕的就是串样,全封闭管路这一点比探头式均质机让人放心。研磨球材质可以换,不锈钢、氧化锆、玻璃球都有,做金属元素检测的样本我们就不用不锈钢球,改用氧化锆或者玻璃,避免金属离子溶出干扰检测。
液氮制冷是我觉得花得值的一块。常温研磨摩擦会生热,几分钟下来管内能到四十度以上,做RNA、做蛋白的人都懂这个温度意味着什么,RNA降解、蛋白变性。这台高通量研磨仪可以配液氮制冷,把适配器和样品先冻透再磨,组织变脆,酶活性也压下去了。小鼠肝脏这种软、又富RNA酶的样本,以前常温磨完条带发糊,冷冻磨完跑胶清亮不少。
高通量组织研磨仪适合谁,不适合谁
适合的:批量做核酸、蛋白提取的课题组,动物组织、植物组织、细胞、微生物多样本前处理,一天几十个上百个样本的那种通量,用它能把前处理时间从大半天压到一两个小时。
不太适合的:每天就三五管样本的,买高通量有点浪费,单样本机型更划算;样本量极小又做金属痕量分析的,要把研磨球材质和材质溶出这条算进去。
预算和选型建议
经费宽裕、样本量大、做RNA和蛋白多的,直接上带液氮制冷的型号,省得以后再补购制冷模块。预算有限、样本偏常温就能磨的,比如干燥植物种子、饲料,基础常温款加后期按需配制冷适配器也行。
研磨仪设备是工具,省下来的前处理时间能多跑几个重复、多取几个对照,这笔账课题组自己算。但也不要盲目的去选择。买之前重点问三件事,一次最多能放多少管、制冷是液氮制冷还是电控温、研磨球和适配器怎么配、售后和耗材多久能到货。
如果你们实验室也跟我们实验室一样,需要大批量的研磨样品,那这款上海净信高通量组织研磨仪JXFSTPRP-1152Plus设备你们可以看一下,做一下对比,如果是少量样本研磨的话,可以选择便携式的研磨仪或者24L的组织研磨仪设备。
