小鼠肝脏单细胞制备总翻车?这台单细胞悬液制备仪帮了大忙
做单细胞实验的人都知道,真正决定实验成败的,很多时候不是测序平台,也不是分析软件,而是最容易被忽略的前处理环节。特别是在组织样本制备阶段。样本解离不充分,后面得到的不是单细胞悬液,而是一堆细胞团块;解离过度,又容易造成细胞破损、活率下降。无论是哪种情况,都会直接影响后续实验结果。
我们课题组最近在开展小鼠肝细胞相关研究,需要将肝脏组织制备成高质量单细胞悬液,用于细胞活率检测以及后续实验分析。这个过程中,尝试过不少传统方法,也踩过不少坑。直到后来使用了上海净信的单细胞悬液制备仪之后,整个实验流程才逐渐稳定下来。今天就结合实际使用过程,聊聊组织解离这件事。
上海净信单细胞悬液制备仪为什么组织解离总是出问题?
很多刚接触单细胞实验的人会觉得把组织打散不就行了吗?可真正开始做实验后才发现,远没有想象中的简单。我们就以我们实验组这次做的肝脏样品为例。
肝细胞本身比较脆弱。如果机械力过大,很容易造成细胞膜损伤。如果处理力度不足,又会残留大量组织碎片。这两种情况都会影响最终结果。
我们最开始采用的是人工剪碎配合移液枪反复吹打的方法。虽然设备要求不高,但操作过程非常依赖经验。力度稍微大一点,细胞活率就会下降;力度不够,组织又无法完全解离。同一个实验,不同实验人员操作,结果经常出现明显差异。对于需要重复验证的数据来说,这显然不是理想状态。后来尝试了酶解+摇床的解决方案,为了解决人工操作带来的实验问题,我们还尝试过酶解配合水浴摇床的方法。
相比手工吹打,确实减少了部分人为干扰。但新的问题又出现了。首先是温度控制,组织消化对于温度要求比较严格,温度偏高或者偏低都会影响酶活;而普通水浴摇床温控精度有限,长时间运行过程中容易出现波动。
其次是样品处理效果的一致性。多个样品同时处理时,经常会出现有的样品已经消化完成,有的样品仍然存在组织残留,批次之间重复性并不理想。随着课题组样品量逐渐增加,这种方法已经很难满足实验需求。
上海净信的单细胞悬液制备仪为什么开始考虑单细胞悬液制备仪?
为什么开始考虑单细胞悬液制备仪?最直接的原因就是效率。过去一个实验往往需要全程盯着。从剪碎、酶解到吹打、过滤,每一步都需要人工参与。不仅耗费时间,而且实验结果容易受到人为因素影响。后来接触到单细胞悬液制备仪后,我们最关注的并不是自动化,而是温控能力和解离效果。因为对于单细胞实验来说,稳定的消化环境比单纯提高速度更重要。
单细胞悬液制备仪的实际使用过程怎么样?
第一次上手时,最大的感受就是操作逻辑比较清晰。设备的体积不大,放在实验台上即可使用。控制界面简单直观,常用程序已经预先设置好。
在实验开始前需要提前解冻消化酶,设备完成预热,随后获取小鼠肝脏组织并进行清洗。将样品剪碎后加入消化管,同时加入约消化酶。接下来基本不需要额外干预。启动设备进行预热,按照设定程序完成组织解离过程。整个过程相比传统方法轻松不少。实验人员不需要频繁观察或者反复吹打。
单细胞悬液制备仪对肝脏组织样品的解离效果到底怎么样?
单细胞悬液制备仪对肝脏组织样品的解离效果到底怎么样?这是大家最关心的问题。程序结束后,我们将消化液转移至离心管,并按照比例加入终止液。随后进行镜检观察。
相比之前使用传统方法处理的样品,变化非常明显。首先是细胞分散状态,显微镜下几乎看不到明显组织团块,细胞分布更加均匀。其次是细胞完整性,肝细胞形态保持较好,没有出现大量破碎细胞,对于后续活率检测来说,这一点尤其重要。因为细胞状态越完整,检测结果越具有参考价值。
单细胞悬液制备仪对肝脏组织样品的解离效果单细胞悬液制备仪自动化应用最大的价值是什么?
很多人认为自动化设备只是省时间。实际上并不完全如此。对于科研实验来说,更重要的是标准化。同样的程序、同样的温度、同样的运行参数、不同批次实验之间更容易保持一致。这也是为什么越来越多单细胞实验室开始采用自动化解离方案。
过去靠经验完成的操作,现在通过程序控制完成,实验重复性自然更容易保障。
实际使用中总结出的两个经验
经过一段时间使用,我们也总结出一些细节。
1. 组织预处理一定不能省。肝脏组织必须充分清洗并尽可能剪碎。很多人把解离效果不好归咎于设备,其实问题往往出在前处理。组织块太大,再好的设备也很难完全解离。
2. 终止液添加要及时。酶解完成后如果不及时终止反应,消化酶会持续作用于细胞。时间一长,细胞活性可能受到影响。这是很多新手容易忽略的问题。
哪些实验适合使用单细胞悬液制备仪?
从目前应用来看,适用范围并不局限于肝脏组织。例如肺组织、脾脏组织、淋巴组织、肿瘤组织、肾脏组织以及部分软组织样本。
对于需要进行单细胞测序、流式细胞分析、细胞培养、细胞活率检测等实验的课题组来说,都具有较高参考价值。
组织解离看似只是单细胞实验中的第一步,但往往决定了后续实验质量的上限。过去我们长期受困于细胞活率波动、样品重复性不足以及人工操作繁琐等问题。使用上海净信单细胞悬液制备仪后,实验流程更加规范,细胞状态也更加稳定。
对于经常开展单细胞研究、细胞活率检测以及组织解离实验的实验室来说,一套稳定的自动化解离方案带来的价值,远不只是节省时间,更重要的是让实验结果更加可靠。
