大数据分析软件samtools安装报错的解决方法error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0

16线程的cpu活力全开跑代码主机竟然没有噪音

8核16线程的cpu-4800H跑大数据分析，设置分析软件使用14个线程（剩下两个线程我是用来浏览网页，还有听歌使用的，毕竟一边跑代码一边也要听歌上网的），其中8个线程100%完全使用（见下图），还有2个线程占用率90%以上，4个线程占用率在71%到89%之间，这么高强度的使用，风扇一点都没有声音（个人感觉cpu满速使用时，主机风扇的声音和图书馆背景噪音一样安静，也就是说，这款迷你主机可以带到图书馆里面来跑代码，不用担心有任何的噪音）。

这款巴掌大小的迷你主机，准系统只要1049元，配备8核16线程，如果你家里有升级剩下的DDR4笔记本内存条，也有多余的固态硬盘的话，买来跑代码非常的省电，全机最大功耗65瓦，cpu的14个线程火力全开，风扇噪音和图书馆里面一样安静，即使旁边有人在睡觉也几乎感受不到这个噪音。

这是我近来发现的跑代码的小钢炮主机，该机有两个DDR4笔记本内存插槽，比较适合24小时不间断跑代码：

这款迷你主机采用8核心16线程的4800H的cpu，cpu典型TDP功耗45瓦（见下图），所以整机最大功耗可以做到65瓦。如果你办公室有显示器和鼠标，你可以像我一样，每天带着上下班，这款主机安装好内存和硬盘后只有645克。

别看4800H这款cpu是笔记本电脑的cpu，cpu benchmarks的跑分1万8,和AMD的5500cpu是一个档次的水平。一句话，这就是性能小钢炮。

samtools第一种安装方法：利用conda来安装

用conda来安装软件非常方便，但是我在安装samtools软件的时候，遇到了问题，conda安装samtools的命令见下图：

无论是使用conda install -c bioconda samtools

还是使用conda install -c "bioconda/label/cf201901" samtools

我发现，无论是用上面的那一种conda安装方法，在运行samtools的时候，都会报错，报错信息如下：

samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared object file: No such file or directory

我在网络上查找了很多资料，例如cd到类似的lib目录下，例如我的电脑是这个目录：~/anaconda3/envs/python2.7/lib，然后ln -s libcrypto.so.1.1 libcrypto.so.1.0.0也还是会报错：

samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared object file: No such file or directory

最后，无奈只能去samtools的官网查找解决方法：

第2种安装方法：按照samtools官网的方法来安装

samtools的官网是类似上图这样的。

首先下载samtools-1.18文件，解压缩后cd到这个文件夹里面，之后执行下面的4步：

第1步：

cd samtools-1.18
其中samtools-1.18是你解压缩之后的生成的文件夹，这个文件夹你要自己决定，因为这个文件夹也许是/home/yasden/samtools-1.18，你将这个samtools-1.18文件解压缩到哪里，这个samtools-1.18文件夹就在那里。

第2步：

./configure --prefix=/你想安装的目录
我这里是设置成./configure --prefix=/home/yasden/RNA-seq/samtools，这个步骤会遇到很多的情况，例如configure: error: liblzma development files not found等类似的问题（见下图遇到的问题是zlib development files not found这样类似的问题）：

遇到像是“某某某development files not found”这些类似问题的时候，就百度解决方法。例如liblzma development files not found就用sudo apt-get install liblzma-dev的方法来安装 liblzma-dev解决，直到运行./configure --prefix=/home/yasden/RNA-seq/samtools没有任何报错为止。

遇到zlib development files not found这样的问题，用sudo apt install zlib1g-dev来解决（见下图，不知道怎么解决就百度）。

第3步：

make

第4步：

make install

第5步：

安装完成后，用sudo vi /home/yasden/.bashrc来修改.bashrc文件：

在.bashrc这个文件的最后添加一行：export PATH=/home/yasden/RNA-seq/samtools/bin:$PATH，并保存退出。

第6步：

运行source ~/.bashrc

这时候，命令行输入samtools就不会报错了。

利用samtools软件见sam文件转化成bam文件，4800H的AMD-cpu的占用情况见上图，铭凡的UM480XT迷你主机只有65瓦，跑大数据分析的时候，风扇的声音都听不见，巴掌大小的铭凡的UM480XT迷你主机绝对是linux跑代码的神器！这台迷你主机大小就是一台iPhone8 plus手机的大小：

全文完，谢谢观看。

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